Осторожно, возможен спойлер:
В альтернативной вселенной, где общество сталкивается с угрозой от таинственных созданий - Ангелов, фундаментальный богатырь Шинджи Икари, подросток, играющий роль пилота колоссального робота «Евангелион», оказывается в центре вселенского катаклизма. В это время его отец, Гендзи Икари, возглавляет компанию NERV, отвечающую за охрану человечества. Шинджи испытывает всепоглощающую тревогу и неуверенность, стараясь найти своё место в этом безумном мире. Его окружает команда, состоящая из пилотов, в том числе Рей Аянами и Асуки Ланглей, которые сражаются с внутренними демонами и сложными отношениями друг с другом.
Пока Шинджи и его товарищи сражаются с Ангелами, они сталкиваются с множеством трудностей, как внешних, так и внутренних. Каждый из них пытается разобраться в своих чувствах, переживаниях и мотивациях. Рей, загадочная и таинственная, постепенно раскрывает свои секреты, а Асука, полная амбиций, погружается в борьбу с личными неуверенностями. В это время миссии NERV становятся всё более подозрительными, вызывая у Шинджи сомнения относительно истинных намерений его отца и самой организации. Они на шаг ближе к разгадке, но каждый новый бой и открытие заставляют их пересмотреть свои взгляды на жизнь и человечество.
Ситуация накаляется, и вскоре начинается «Проект Третьего Ударения», угрожающий не только их существованию, но и самой сущности человечества. Шинджи, разрываясь между желанием спасти своих друзей и страхом перед неизведанным, оказывается перед выбором, который изменит всё. Его внутренние конфликты становятся с каждым днем всё острее, а реальность начинает искажаться, открывая новые горизонты как для него, так и для всего мира.